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尽管可再生能源有很明显的优点，但他们仍然有缺点，主要体现在以下几个方面： 1.间歇性：很多可再生能源都存在间歇性的问题，比如风能，全年的风速一定是变化的，不可能维持在一个稳定的数值，因此风能产生的电力也是不定的，太阳能也是如此，首先晚上没有太阳，其次随着天气季节的变化，太阳辐射的强度也是变化的，水能同样要面临着枯水期和涨水期的问题，水位的高低会影响水力发电。此外还需要考虑极端天气的影响，例如：台风和洪水。由此也引出了下一个问题。 2.存储：化石能源不太需要考虑储能的问题，因为能量都储存在化石燃料里，而可再生能源则需要通过储能来解决这一问题。目前比较好的储能方式都需要可再生能源与化石能源结合使用，这样不能解决根本的问题。 3.分布性：虽然世界上各个国家和地区化石燃料的分布也有差异，但是可以通过贸易和运输来解决，可再生能源则存在很大的先天性，毕竟风力，太阳辐射，地热和潮汐这些肯定无法交易和运输。 4.技术与成本：尽管很多可再生能源是免费的，例如太阳能和风能，但是获取这些能源的设备同样需要成本，而且这些设备同样还需要维护成本。与此同时，涉及可再生能源的技术难度也大于已经成熟的化石能源，在很多发展中国家，同样难以推行。